35、Unix与Perl编程：数据检查、求助途径及问题解决

Unix与Perl编程：数据检查、求助途径及问题解决

数据检查的重要性

在处理数据时，特别是DNA序列等专业数据，要确保数据的有效性。例如，某些字符不应出现在特定序列中，像“X”不能代表核苷酸，“J”不对应任何氨基酸；若下载对应基因的DNA序列，其编码部分长度应是三个核苷酸的倍数。

当面对大量数据时，不能仅靠肉眼检查。若对数据有怀疑，可以花一两个小时编写简单的“检查”脚本。比如，对于数据的合理性可以有一些基本推测：起始坐标应在结束坐标之前；“事物”的长度通常为非零值；化石、挖掘物或古代文明的年代不应超过46亿年。总之，永远不要盲目信任数据，一定要仔细检查。

内置支持工具

当在Unix或Perl编程中遇到问题时，可先利用计算机上的内置支持工具。
-Unix的man命令：每个Unix命令的文档都包含在man页面中，可使用man命令访问。
-Perl的perldoc命令：
-查看函数描述：使用perldoc -f加上函数名，可查看Perl函数的描述。例如，查看int函数：

$ perldoc -f int int EXPR int Returns the integer portion of EXPR. If EXPR is omitted, uses $_. You should not use this fu